viernes, 18 de mayo de 2012

AGUAS. Articulo 5.


En este artículo se propone un método eficiente de muestreo conformacional de macromoléculas biológicas en las moléculas de agua explícitas, llamado el método multicanonical mejorado de forma selectiva. Este método aumenta la eficiencia de muestreo en el espacio de energía para las interacciones soluto-soluto y soluto en agua utilizando el algoritmo multicanonical, mientras que restringe el muestreo del espacio de energía de agua-agua. Se aplicó el método actual y el método convencional multicanonical a un y demostraron que se requiere mucho menos tiempo de cálculo para el método actual que para el convencional.




Referencia:



A selectively enhanced multicanonical molecular dynamics method for conformational sampling of peptides in realistic water molecules
Nobuyuki Nakajima



Department of Bioinformatics, Biomolecular Engineering Research Institute (BERI), 6-2-3 Furuedai, Suita, Osaka 565, Japan

Received 23 January 1998; in final form 26 February 1998

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